Профспілкова організація працівників ТНПУ ім. В. Гнатюка – це громадська організація працівників університету, метою якої є представництво та захист трудових, соціально-економічних прав та інтересів своїх членів профспілки. Вступ до профспілки проводиться на добровільних засадах, без будь-якого обмеження через національність, расову приналежність, стать, партійність або релігійні переконання. 

Профком працівників організовує роботу профспілкового комітету та поточну діяльність профспілкової організації університету; укладає та контролює виконання колективного договору, звітує про його виконання на загальних зборах трудового колективу, здійснює функції, передбачені п.п.49-51 Статуту профспілки працівників освіти і науки України. 

З часу переведення нашого вузу з Кременця до Тернополя профспілкову організацію очолювали: Козенко Г.М. (1969–1970 рр.), Кузьмович Л.Г. (1970–1971 рр.), Маланюк М.П. (1971–1972 рр.), Грибчук І.С. (1972–1973 рр.), Богайчук В.І. (1973–1974 рр.), Зеленський В.С. (1974–1975 рр.), Свинко Й.І. (1976–1978 рр.), Бутницький І.М. (1978–1979 рр.), Кравець В.П. (1979–1981 рр.), Зеленський В.С. ( 1981-1983 рр.), Яковлєв В.О. (1983-1988 рр.), Гап’юк Я.Ф. (1988–1991 рр.), Чорнописький М.Г. (1991–1993 рр.), Заставецька О.В. (1993–1994 рр.), Фартушняк А.К. (1994–2001 рр.),  Григорук А.А. (2001 р.–14.07.2023рр.) . З 21.09.2023 року – Каплун І.Г.

До складу профкому працівників університету входять: голова, два заступники, голови профбюро десяти факультетів, адміністративної і  господарської частин, наукової бібліотеки. 

У профкомі функціонують постійно діючі комісії: з організаційної роботи, з питань захисту соціально-економічних інтересів членів профспілки, культурно-масової роботи, спортивно-оздоровчої роботи та охорони праці.

До 1991 року фінансами профспілки розпоряджався скарбник. Останньою цю посаду займала  Давидович О.М. З 14  січня 1991 року і до сьогодні  бухгалтером  працює  Шаруга Т.В.

Профорганізація ТНПУ ім. В.Гнатюка – постійний призер обласної спартакіади працівників вищої школи. За підсумками 2010 р. первинна профспілкова організація працівників зайняла ІІ місце в обласному огляді конкурсі «Краща профспілкова організація у номінації «Краща первинна організація вищого навчального закладу» та  стала переможцем обласного конкурсу «Краща профспілкова організація Тернопільської обласної ради профспілок у номінації «Краща профспілкова організація бюджетної сфери».

В 2011 р. первинна профспілкова організація працівників ТНПУ ім.В.Гнатюка визнана Федерацією профспілок України переможцем всеукраїнського огляду – конкурсу первинних профспілкових організацій і нагороджена відповідним дипломом (Постанова ФПУ № П-1 від 24.05.2011р.). У лютому 2014 р. Рада Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки нагородила Первинну профспілкову організацію за І місце в обласному огляді-конкурсі на кращу профспілкову організацію в номінації «Краща первинна профспілкова організація ВНЗ (працівники)», а Президія Тернопільської обласної ради профспілок нагородила Первинну профспілкову організацію університету переможцем обласного конкурсу «Краща профспілкова організація Тернопільської ради профспілок». 

Серед визнання роботи профспілкової організації університету також: Диплом Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України в номінації «Краща первинна профорганізація», за удосконалення внутріспілкової роботи (2015 р.), Почесний знак Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України за активне сприяння оздоровчої кампанії (2015 р.), Відзнака Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України в номінації «Краща первинна профорганізація ВНЗ і ПВНЗ (працівники)» (2017 р.), Диплом переможця обласного огляду-конкурсу на кращу профспілкову організацію в номінації «Краща первинна профорганізація ВНЗ і ПВНЗ (працівники)», за активну діяльність щодо захисту прав та інтересів спілчан у 2017 р. (2018 р.), Диплом Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України за успішну діяльність у виконанні програми «Спілчани. Здоров’я та довкілля» щодо організації оздоровлення й відпочинку дітей працівників освіти у 2018 р. (2018 р.), Диплом Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України за успішну діяльність у виконанні програми «Спілчани. Здоров’я та довкілля» щодо організації оздоровлення й відпочинку  працівників закладів освіти у 2018 р. (2018 р.), Почесна грамота Тернопільської обласної організації профспілки працівників освіти і науки України за активну та успішну діяльність щодо виконання програми «Спілчани. Здоров’я та довкілля» у 2019 р. (2019 р.).